A Crysis dzsungelei után a második rész egy új terepre kalauzolja el a játékost: New York városába, amit megszálltak az idegenek. Itt kell felvenned a harcot ellenük, melyben a nanoruhád új képességei is a segítségedre lesznek. A taktikus játékmenet helyett ezúttal inkább a frontális akció kerül előtérbe. A zenéért a méltán elismert Hans Zimmer (A Sötét Lovag, Interstellar) felel.