A Far Cry 3-mal a játékosok Jason Brody bőrébe bújnak, aki egy misztikus trópusi szigeten ragad. Ebben a törvények nélküli és erőszakos világban egy dolog biztos: a játékos dönti el, hogyan bontakozik ki a történet. Te döntesz, melyik frakcióhoz csatlakozol, és ki lesz az út során az ellenséged. A Far Cry 2-ből megismert harcrendszer tovább bővül a lopakodás lehetőségével. Rajtad áll, hogy milyen stílusban teszed el az ellenfelet láb alól.